Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp16-psI6L890 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casp16-psI6L890 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms