Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf4bG5E8Z2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms