Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn20G5E8X0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn20G5E8X0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn20G5E8X0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cldn20G5E8X0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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