Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms