Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nccrp1G3X9C2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nccrp1G3X9C2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms