Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r76F8VQ63 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r76F8VQ63 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms