Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M1F7CXU4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms