Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8005F6YKY3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8005F6YKY3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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