Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8220F6YKI2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8220F6YKI2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms