Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm42421F6X8D5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm42421F6X8D5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm42421F6X8D5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm42421F6X8D5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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