Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm340F6RGI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms