Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc74aE9Q9U8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.3 ms