Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TrdnE9Q9K5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrdnE9Q9K5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms