Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc146E9Q9F7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms