Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930579F01RikE9Q3L6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms