Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifit3bE9PV48 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifit3bE9PV48 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms