Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms