Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
3425401B19RikD3Z1D3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
3425401B19RikD3Z1D3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms