Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lonrf1D3YY23 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms