Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc170D3YXL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc170D3YXL0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms