Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SafbD3YXK2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SafbD3YXK2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms