Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CatipB9EKE5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CatipB9EKE5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms