Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm4787B2RUD9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4787B2RUD9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm4787B2RUD9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4787B2RUD9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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