Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU022751B1B0V2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AU022751B1B0V2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU022751B1B0V2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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