Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhox1B1APN4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms