Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.05■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms