Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Palm3A2TJV2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Palm3A2TJV2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms