Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syndig1A2ANU3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms