Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grin3aA2AIR5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms