Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc25a53A2AF28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc25a53A2AF28 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms