Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp1bA1Z198 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms