Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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