Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SacsQ9JLC8 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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SacsQ9JLC8 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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SacsQ9JLC8 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SacsQ9JLC8 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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SacsQ9JLC8 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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SacsQ9JLC8 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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SacsQ9JLC8 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SacsQ9JLC8 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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