Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BcanQ61361 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms