Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp48Q3V0C5 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms