Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
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