Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpreP49446 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtpreP49446 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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