Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rtf1A2AQ19 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rtf1A2AQ19 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rtf1A2AQ19 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Rtf1A2AQ19 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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Rtf1A2AQ19 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rtf1A2AQ19 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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