Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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