Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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