Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Ccdc18Q640L5 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Ccdc18Q640L5 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Ccdc18Q640L5 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Ccdc18Q640L5 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Ccdc18Q640L5 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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