Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Sh3bp1P55194 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Sh3bp1P55194 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Sh3bp1P55194 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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