Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccdc88cQ6VGS5 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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Ccdc88cQ6VGS5 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc88cQ6VGS5 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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