Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Col5a3Q9JLI2 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Col5a3Q9JLI2 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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