Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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Hoxd13P70217 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd13P70217 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms