Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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