Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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