Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Hoxd9P28357 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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