Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms