Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms